地球は46億年前に誕生し、38億年前に出現した生命とともに、その姿を大きく変えてきました。地球が変動して生命の生息環境を変化させる一方で、生命も地球環境に変化を及ぼしてきました。そんなダイナミックな地球が生んだ様々な産物がこの博物館に集められています。地球の変遷を記録している岩石や鉱物、生命の進化の証拠となる化石、地球環境の指標となる現生生物といった60万点を超える標本が、大学創立以来の地球科学の研究活動によって蓄えられており、そのうち約1200点を常設展示しています。また、考古学や金属学、化学などの他の学問分野の貴重な資料や最新の研究活動を紹介するコーナーもあります。
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