館內展示著眾多男鹿、秋田海域的生物，讓人能充分探索距離雖近卻難有機會實際造訪的日本海生態。除了有名為豪太和Yuki的北極熊以外，亦展示著包括秋田縣縣魚「日本叉牙魚」等來自國內外約400種的生物，總數則多達1萬隻。其中，重現男鹿春季至秋季海洋生態的「男鹿大水槽」更是壯觀。由此水族館前往戶賀灣、入道崎、門前、大棧橋和櫻島等其他觀光景點也相當便利。