มีทฤษฎีเล่าว่าหมู่บ้านมิซุฮิกิมีต้นกำเนิดมาจากการที่นายพรานหลงเสน่ห์ความงามของน้ำผุดจนมาปักหลักอาศัย ในปัจจุบันด้านข้างของเทพเจ้าแห่งภูเขานี้ก็ยังมีน้ำใสสะอาดผุดขึ้นมามากมาย

แม้บ้านทุกหลังในหมู่บ้านจะมอดไหม้ไปเพราะเกิดเหตุไฟไหม้ครั้งใหญ่เมื่อยุคเมจิปีที่ 19 (ปี 1886) และยุคเมจิปีที่ 29 (ปี 1896) แต่ในปัจจุบันยังเหลือบ้านหลังคามุงฟางอยู่ 5 หลังที่บูรณะกลับมาตามวิธีโบราณหลังจากเหตุไฟไหม้ครั้งใหญ่

ยังไม่มีลานจอดรถเนื่องจากไม่ได้ถูกปรับให้เป็นสถานที่ท่องเที่ยว เชิญชวนให้คุณมาสัมผัสกับความเงียบสงบจากทิวทัศน์แต่ละฤดูกาลของหมู่บ้านในภูเขาและรูปลักษณ์ของหมู่บ้านที่อยู่ท่ามกลางป่ากับน้ำ