６月下旬から９月下旬にかけてチングルマ、イワカガミ、ニッコウキスゲ等の様々な高山植物が咲き誇り、「花の百名山」の一つとして親しまれています。

森吉山阿仁スキー場のゴンドラで山頂近くまで行くことができ、多くの人々が、トレッキングや登山、花めぐりなどアウトドアアクティビティを楽しんでいます。

また、冬に観賞することができる「森吉山の樹氷」は、「蔵王の樹氷」や「八甲田山の樹氷」と並ぶ日本三大樹氷の一つとしても有名です。