2021年7月に世界文化遺産に登録された「北海道・北東北の縄文遺跡群」の構成資産の1つです。

二ツ森貝塚は縄文時代前期から中期（紀元前3,500年～2,000年頃）にかけ、小川原湖西岸に形成された貝塚を伴う集落跡です。

同時期の貝塚としては東北地方でも最大規模とされ、当時の環境や生業、集落構造を考えるうえで重要であるとして、平成10年に史跡指定を受けました。

遺跡の東地区は「二ツ森貝塚史跡公園」として開放され、復元竪穴住居や案内看板等が設置されています。